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Accéder à Python

Pour accéder à Python, vous devez d'abord charger la version que vous souhaitez utiliser, en utilisant nos modules, par exemple:

module load python2/miniconda2    # conda + python 2.7 /sca/compilers_and_tools/python/miniconda2
                                  # NE PLUS supporté

   ou
module load python3/miniconda3    # conda + python 3.7 /sca/compilers_and_tools/python/miniconda3
   ou
module load python3/miniforge3    # conda + python 3.9 /sca/compilers_and_tools/python/miniforge3

Charger des environnement/paquets Python

Pour lister les environnements disponibles exécutez:

conda env list
    ou
conda info --envs

Pour lister les paquets qui font partie d'un environnent exécutez:

conda list -n nom_du_env

Disponible avec python2 (non recommandé pour le futur) (gelé dans son état actuel)

source activate jupyter              # jupyter notebooks
source activate mysql2               # mysql-connector
source activate pynngl2              # NCAR Graphics (PyNGL et NCL)
source activate spyder               # environnement spyder
source activate soup                 # beautifulsoup

module load development/python-rpn   # interface python pour rmnlib - Documentation


Disponible avec python3 (miniconda3)

source activate cdo                  # cdo toolkit
source activate jupyter              # jupyter notebooks (sera remplacé par base_plus)
source activate jupyter_plus         # jupyter notebooks + basic packages (recommandé plutôt que jupyter)
                                     # remplacé par base_plus
source activate jupyter_sql          # jupyter notebooks + mysql-connector
                                     # remplacé par base_plus
source activate base_plus            # le successeur des environnements jupyter... + xarray/dask  # ensemble de base
source activate spyder               # environnement spyder
source activate mysql3               # mysql-connector
source activate ldap                 # ldap utilities + mysql-connector
source activate pynngl3              # NCAR Graphics (PyNGL et NCL)
source activate magics               # magics (ECMWF)
source activate soup                 # beautifulsoup

module load python3/python-rpn       # interface python pour rmnlib - Documentation
module load python3/outils-divers    # functions pour les grilles RPN
module load python3/demos            # exemples des scripts pour lire/imprimer des fichier RPN

Disponible avec python3 (miniforge3)

source activate base_plus            # le successeur des environmenta jupyter... + xarray/dask
source activate ferret               # pyferret

Environnement personnel

Création et activation d'un environnement personnel (dans ~/.conda)

NOTE:
Les packages installés avec pip (qui aboutissent souvent dans ~/.local)
peuvent entrer en conflit avec les packages installés dans les environnements conda

conda create -n mon_environnement
source activate mon_environnement
cd ~/.conda                                                  # Assurez-vous que
                                                                           #    ~/.conda est un lien vers ~/extras/.conda et
                                                                           #   
~/extras est un lien vers /extras/${USER}
                                                                           # Sinon vous allez bientôt manquer d'espace dans votre home!

conda install package_name

Déchargement d'un environnement


conda deactivate                                          # sortir d'un environnement

Références utiles

NCAR graphics (ncl)

NCAR graphics (PyNGL)

jupyter (notebook)

beautifulsoup

Magics(ECMWF)

spyder (environnement de développement python)


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